SOŠ OOM Brno je partnerská škola Masarykovy univerzity.
Tento program je iniciován Masarykovou univerzitou v Brně, jeho cílem je rozvinout užší spolupráci mezi Masarykovou univerzitou a středními školami v České republice a v zahraničí.
SOŠ OOM Brno spolupracuje s Fakultou sportovních studií Masarykovy univerzity na projektu NA HŘIŠTI I NA VODĚ BÝT S DĚTMI VŽDY V POHODĚ.
SOŠ OOM Brno také spolupracuje s Fakultou sportovních studií Masarykovy univerzity na projektu Inovace bakalářského studijního oboru Speciální edukace bezpečnostních složek a navazujícího magisterského studijního oboru Aplikovaná sportovní edukace bezpečnostních složek.